El municipio forma una franja alargada que ocupa la región media del Guadalquivir, caracterizada por una orografía llana. En la zona norte del término, el paisaje es montañoso, abundando el pinar, la encina y la vegetación característica de monte bajo. El término municipal de Villanueva de la Reina forma parte del Parque Natural Sierra de Andújar. Su término municipal limita al noreste con el término de Baños de la Encina, al este con los términos de Espelúy, Bailén y Lahiguera, al sureste con el término de Cazalilla, al sur con el término de Fuerte del Rey y al oeste con el término de Andújar. Una de las virtudes y reconocimiento de su termino es su gran situación geográfica ya que por el pasa el rio Guadalquivir, la Campiña Sur de Jaén. Además su magnifica situación con respecto a la A-4 lo convierte en un pueblo de paso, para muchos viajeros y visitantes.
