Junta de Villalba de Losa es un municipio español, situado en la comarca de Las Merindades, en la provincia de Burgos, comunidad autónoma de Castilla y León. Tiene un área de 45,96 km². La localidad de Villota, hoy despoblada, está situada 11,5 km al oeste y queda enclavada en el municipio vecino de Valle de Losa, junto a las localidades de Baró, Villacián y Teza y Orduña. Se encuentra en la vertiente mediterránea de la provincia, bañada por el Río Húmedo al sur de la Sierra de Salvada y junto al Monumento Natural del Monte Santiago.