Santa Cecilia es un municipio y localidad de la comarca del Arlanza en la provincia de Burgos, Castilla y León (España).

Se encuentra situado a 42 Kilómetros de Burgos, abarca una extensión de 13 km². El pueblo, que data de la Edad Media, fue fundado durante la repoblación mozárabe del Medio y Bajo Arlanza, después del año 912 coincidiendo con el traslado de la línea de defensa cristiana al río Duero.