San Mamés es una localidad y un municipio situados en la provincia de Burgos, en la comunidad autónoma de Castilla y León (España), comarca de Alfoz de Burgos, partido judicial de Burgos, cabecera del ayuntamiento de su nombre. Tiene un área de 5,01 km². 

El municipio comprende también la localidad de Quintanilla de las Carretas, también conocida como Quintanilleja.

El 23 septiembre de 1891 tuvo lugar un choque de trenes en el pueblo que provocó una gran cantidad de víctimas. Colisionaron una locomotora procedente de San Sebastián con un tren que llegaba desde Valladolid.